2020年1月底至2月初期間，各國在中國的大部分簽證中心相繼關閉。百程旅行網的創始人、董事長兼CEO曾松公開表示，公司債務過高，在疫情影響下，旅游消費需求幾乎為零，公司已經無法支撐。

在網傳的《關于公司決定關閉公司啟動清算準備的通知》的百程內部郵件顯示，因受新冠肺炎疫情影響，資金不能維系公司繼續運轉，百程旅行決定關閉公司并啟動清算準備，請員工給予理解和支持，并提前做好自謀出路的準備。

出境旅游發展初期，全國有資質的涉外旅游社數量有限，而簽證作為出境旅游的第一把“鑰匙”，在出境游環節中至關重要。百程瞅準商機，借勢而上，發展成為國內最大的線上簽證服務機構之一，公司除了簽證業務外，還有旅游度假服務、目的地服務以及企業國際商務旅游等業務。隨著出境旅游的發展日益興盛，簽證業務的利潤基本處于公開狀態，其營收難以支撐較大體量的企業發展。

北京聯合大學在線旅游研究中心主任楊彥鋒在接受記者采訪時指出：“面臨越來越激烈的市場競爭，百程主打的簽證業務的毛利也在逐步下降，長此以往，難以抵擋來自OTA頭部企業的沖擊。此次疫情只是加速了百程啟動清算的步伐。”