德國商標的注冊程序從遞交申請到審查結果公示，一般需要三個月左右的時間。如果請求加快審查（需繳納相應的費用）在擬注冊商標本身不存在問題的前提下，審查流程可以在一個月內完成并公示。以下從遞交、審查和注冊三個階段，對德國商標注冊流程進行介紹。
（一）遞交階段
申請人通過線上或線下方式遞交申請材料后，可立即從DPMA得到含有申請號等信息的受理通知書。如申請主張優先權，申請人應提供在先申請國家和申請日期信息，并在兩個月之內向DPMA提供在先申請的申請號（即優先權號）以及在先申請文件的副本（§ 34(3)MarkenG）。
（二）審查階段
1.形式審查
在形式審查過程中，官方如果發現申請所需的基本信息（§ 33(1) MarkenG）存在缺陷，則會要求申請人在官方設定的期限內進行補正。如果申請人在官方規定期限內能夠補正相應的缺陷，官方會將相應缺陷被補正之日視為商標申請日。官方如果發現存在需補繳的費用，則會要求申請人在官方設定的期限內進行補繳。如果未能在期限內補正相應的缺陷或費用，該申請將依據具體缺陷情況被駁回（§36(4) MarkenG）、被視為撤回（§ 36(2) MarkenG）或者在相應部分商品和服務上被視為撤回（§ 36(3) MarkenG）。
2.實質審查
在實質審查過程中，如果存在絕對駁回理由（缺乏顯著性、誤導公眾、商標中包含國家標志、違反公共政策或道德原則等），該商標申請將部分或全部被駁回（§37 MarkenG）。如果申請人在遞交申請被駁回時，申請人進行相關修改后，經其同意，可以將絕對駁回理由消失之日作為新的申請日。（§37(2)MarkenG）。相對駁回理由審查主要考量是否存在在先相同或近似商標，DPMA對商標的實質審查階段并不涉及相對駁回理由，即官方不會審查擬申請的商標是否與他人的在先權利相沖突。
3.異議審查
目前DPMA針對商品和服務的異議申請理由主要為：
（1）擬注冊商標與他人在先的注冊商標或商標申請之間存在混淆；
（2）擬注冊商標與他人在先的知名商標之間存在沖突；
（3）擬注冊商標與他人在先的未注冊商標（使用商標）之間存在混淆危險；
（4）擬注冊商標存在代理人搶注情況；
（5）擬注冊商標與他人在先的其他商業標識（如企業名稱）之間因存在混淆。
商標公告發布以后的三個月內，任何第三方可以向DPMA書面遞交異議申請，闡述擬注冊商標因何原因不得被官方注冊（§37(6)MarkenG）。
（三）注冊階段
如果商標申請滿足法定要求且沒有因絕對駁回理由被駁回，那么申請的商標就會被核準注冊，相關注冊公告可以通過電子方式進行公示（§ 41(1), (2) MarkenG）。
德國現行商標法，主要將商標類型分為普通商標、集體商標和證明商標。
1.普通商標
普通種類包括：簡單文字商標、組合文字/圖形商標和簡單圖形商標（不含文字元素），有三維商標、顏色商標、聲音商標、位置商標、示蹤商標、圖案商標、運動標記、多媒體標記、全息標記和其他類型的標記。
2.集體商標
集體商標的所有人是具有法律行為能力的協會，不同于商標傳統的區分產品和服務的功能，集體商標僅限于協會成員使用，是獲得協會對產品來源認可的憑證。
3.證明商標
證明商標是指由獨立機構對商品/服務的某些特征進行認證，可供多家公司使用。任何非商品生產商、貿易商或服務供應商的自然人或法人都可以是證明商標的所有人。
| 費用類型 | 金額 |
| 普通商標基本申請費 （包括首三個類別的費用） | 300歐元 |
| 普通商標在線基本申請費 （包括首三個類別的費用） | 290歐元 |
| 集體商標和證明商標基本申請費 | 900歐元 |
| 普通商標類別申請費 （第四類別，以及每增加一類別） | 100歐元 |
| 集體商標和證明商標類別申請費 （第四類別，以及每增加一類別） | 150歐元 |
| 加速申請審查費 | 200歐元 |
